AnnotationYoPe est un outil d'annotation de séquences biologiques utilisant la méthode EggNOG. Il permet l'analyse de séquences, la classification d'organismes et la recherche d'homologies de gènes.

Le projet culebront_pipeline est dédié à l'assemblage et l'analyse de génomes à partir de lectures longues. Il offre des fonctionnalités d'analyse et de visualisation de données génomiques, permettant une meilleure compréhension des données et facilitant la prise de décision dans le domaine de la génomique.

Frangipane est un projet dédié à l'analyse et la visualisation de données biologiques, offrant une gestion simplifiée des workflows de recherche. Il permet aux scientifiques d'accélérer et d'optimiser leurs processus de recherche en fournissant des fonctionnalités d'analyse avancées et de visualisation claire et interactive.

RattleSNP est un projet dédié à l'analyse de données génomiques, proposant un workflow snakemake pour le mapping de données simples ou appariées. Il offre des fonctionnalités de visualisation de données biologiques grâce à matplotlib et tabulate, ainsi qu'une gestion optimisée des dépendances grâce à biopython, numpy et pandas.

RNAja est un pipeline écrit en snakemake permettant d'analyser des données RNAseq, de réaliser des analyses différentielles d'expression en utilisant plusieurs mappeurs et compteurs. RNAja est le seul pipeline capable de comparer les effets des méthodes sur les gènes différentiellement exprimés.

IKISS est un projet d'analyse de génomes bactériens permettant l'identification de souches et la détection de mutations sous sélection. Il s'appuie sur des méthodes bioinformatiques avancées pour fournir une analyse précise et fiable des données de séquençage.

PodiumASM est une pipeline Snakemake open-source, évolutive, modulable et traçable, conçue pour comparer plusieurs assemblages de génomes à longues lectures obtenus à partir de divers outils d'assemblage. Ce workflow permet de choisir le meilleur assemblage parmi toutes les possibilités.

Outil simple permettant de télécharger et traiter des images Sentinel-2, facilitant ainsi la gestion et l'analyse de données géospatiales pour une meilleure compréhension de la couverture terrestre.

Le projet azfp_data_processing est dédié au traitement et à l'analyse de données financières et économiques. Il permet de gérer des workflows de données complexes, d'assurer leur traçabilité et de générer des rapports détaillés.

This software is designed for the calibration and processing of CTD data, commonly used in oceanography for measuring conductivity, temperature, and depth. It provides automated data analysis, quality control, and ensures accurate measurements for oceanographic research.