Le projet GAEV a pour objectif de créer une preuve de concept (POC) d'une infrastructure logicielle permettant de gérer des environnements virtuels pour des applications scientifiques. Il facilite la mise à disposition d'applications scientifiques préinstallées et configurées, et s'inscrit dans une démarche qualité de science ouverte pour le partage et la reproductibilité.

Le Portail Calcul-Stockage-Cloud est un outil communautaire d’aide aux scientifiques pour simplifier le paysage des offres de ressources de calcul, de stockage et de cloud, et proposer une documentation adaptée aux débutants.

Ce projet est une initiation à Git, un système de contrôle de version décentralisé. Il permet aux utilisateurs d'apprendre les bases de Git, de gérer leurs versions de code source et de collaborer avec d'autres développeurs. Le projet est intégré à GitLab pour offrir des fonctionnalités avancées telles que la gestion de projets, le suivi des problèmes et le déploiement continu.

Ce projet vise à fournir des tutoriels et des ressources pour l'utilisation de Singularity, un outil de conteneurisation logicielle. Il couvre des sujets tels que l'installation de Singularity, la création et l'utilisation d'images Singularity, l'utilisation de CI/CD pour la création automatique d'images, l'utilisation du système de packaging Conda dans des conteneurs, la création d'images pour l'exécution de code MPI, la réutilisation d'images de bases préconstruites et la création d'images pour des services en conteneurs.

Le projet dbeel vise à faciliter l'intégration et la gestion des données de DAMs (Dépôts d'Archives Multimédias) et d'électrofishage. Il offre des scripts et des outils pour automatiser les workflows de gestion des données et améliorer l'interopérabilité entre les différentes sources de données.

Le projet ETL_data_portals est responsable de l'intégration, du transfert et du traitement de données en provenance de différents portails. Il automatise le processus de collecte, nettoie et transforme les données pour garantir leur qualité et leur cohérence.

Ce projet est une formation sur l'utilisation de Virtualenv et Conda pour la gestion d'environnements virtuels dans le développement Python. Il permet de créer des environnements isolés et de gérer les dépendances de manière efficace.

Le projet irrig est une ontologie spécifique dédiée à l'expérimentation en irrigation à Irstea, centre de Clermont Ferrand. Il fournit des données et des informations essentielles pour soutenir l'expérimentation dans ce domaine.

Le projet Sashimi est une méthodologie introduite dans l'article "Domain-topic models with chained dimensions: Charting an emergent domain of a major oncology conference" qui emploie la bibliothèque python sashimi. Il fournit une analyse de données médicales, la détection de tendances dans les conférences médicales et la visualisation de données oncologiques.

Ce projet consiste en l'annotation des éléments transposables du génome d'Aegilops umbellulata grâce à la pipeline CLARI-TE_smk développée au sein de l'unité de recherche GDEC de l'INRAE. Ce projet a été mené en collaboration avec Gill Upinder de l'Université d'État du Dakota du Nord.