COVflow est un pipeline bioinformatique dédié à l'analyse phylogénétique et phylodynamique des séquences génomiques du SARS-CoV-2. Il permet de filtrer, aligner et masquer les sites des données génomiques, de construire et d'évaluer des arbres phylogénétiques, puis de générer des fichiers XML prêts à l'emploi pour des analyses phylodynamiques avancées avec BEAST2. L'outil facilite l'étude de la dynamique de transmission du virus et l'estimation de paramètres épidémiologiques clés.

Ce projet est un simulateur en C++ basé sur un modèle de champ moyen pour reproduire la dynamique d'un modèle SIR (Susceptible-Infecté-Rétabli). Il permet d'étudier la propagation d'une épidémie en analysant l'évolution des populations au fil du temps, en intégrant des paramètres comme le taux de transmission ou de guérison.

Ligne de transmission est un projet dédié au transport fiable de données entre entités distantes. Il supporte divers protocoles de communication et veille à la fiabilité des transmissions.