Sambamba est un outil en ligne de commande permettant d'effectuer des opérations performantes sur des données génomiques, telles que l'alignement, le tri, la réduction de taille et l'analyse de données de séquençage.

Methylome est un workflow FAIR optimisé pour l'étude du méthylome des génomes de poisson, utilisant Nexflow dsl2, Singularity et Slurm. Il permet le prétraitement de données de séquençage à haut débit, l'alignement, la suppression des duplicats et l'appel de méthylation, grâce à Trim Galore, Bismark et bedGraphToBigWig.