methylome
Methylome est un workflow FAIR optimisé pour l'étude du méthylome des génomes de poisson, utilisant Nexflow dsl2, Singularity et Slurm. Il permet le prétraitement de données de séquençage à haut débit, l'alignement, la suppression des duplicats et l'appel de méthylation, grâce à Trim Galore, Bismark et bedGraphToBigWig.
Cas d'utilisation métiers
- Étude du méthylome des génomes de poisson : rechercher des initiatives proches
- Gestion de workflows bioinformatiques : rechercher des initiatives proches
- Prétraitement de données de séquençage à haut débit : rechercher des initiatives proches
- Analyse de données épigénétiques : rechercher des initiatives proches
Organisation
- Centres de recherche régionaux de l'INRAE (organisation rattachée)
Description générée le mercredi 20 mars 2024 à 10:14:09
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