Ce projet vise à étudier les ondes corticales observées chez la souris en laboratoire. Il permet de détecter, suivre et analyser ces ondes ainsi que les mouvements corporels des animaux. Les outils développés automatisent le traitement des données brutes, calculent des paramètres descriptifs et génèrent des visualisations pour faciliter l'interprétation des dynamiques corticales. Les résultats sont utilisés pour approfondir la compréhension des mécanismes neuronaux.

GATB-CORE est une bibliothèque C++ hautes performances et à faible empreinte mémoire dédiée à l'analyse de données de séquençage à haut débit. Elle fournit des algorithmes efficaces pour la manipulation de jeux de données de grande taille sur des ordinateurs de bureau multi-cœurs, y compris des données de séquençage provenant de n'importe quel type d'organismes, tels que des bactéries, des plantes, des animaux et même des échantillons complexes (par exemple, des métagénomes).

Ce projet fournit un ensemble de fonctions R pour faciliter le calcul des paramètres démographiques à partir de données d'enquêtes issues de l'outil 12MO. Il s'appuie sur des méthodes décrites dans un manuel méthodologique dédié, permettant d'analyser des données de suivi de troupeaux en milieu tropical. L'outil est particulièrement utile pour les chercheurs et professionnels en zootechnie ou épidémiologie animale.

Le projet GeoLifeCLEF vise à analyser des données géolocalisées pour reconnaitre des espèces végétales et animales, dans le but de suivre la biodiversité. Il fournit des exemples de chargeurs de données et des échantillons de données pour aider à utiliser les données du défi GeoLifeCLEF.

RCAviz est un outil en ligne dédié à la visualisation et à l'exploration de connaissances organisées en classifications interconnectées grâce à l'Analyse de Concepts Relationnels. Il permet d'analyser des structures complexes pour faciliter la compréhension et l'exploitation de données relationnelles, notamment dans des domaines comme la santé végétale et animale. Développé dans le cadre de projets de recherche, il offre une interface intuitive pour naviguer et interpréter des données structurées.

Laser est un logiciel dédié au suivi et à l'analyse des données d'élevage, notamment pour les troupeaux de ruminants en milieu tropical. Il permet de collecter, gérer et analyser des informations précises sur la démographie des animaux (naissances, mortalités, ventes, achats), leurs productions (lait, croissance), ainsi que les interventions zootechniques ou médicales. Utilisé par des organismes de recherche et des projets scientifiques, il facilite la création de références techniques pour évaluer la productivité des races ou l'impact d'innovations en élevage.

Module dédié à la gestion et au suivi des individus animaux en milieu naturel. Permet d'enregistrer, modifier et consulter les données des animaux individualisés via des dispositifs d'identification (marquages, émetteurs, analyses génétiques). Facilite également le suivi des déploiements de dispositifs sur ces individus pour des études écologiques ou de conservation.

MetaQTL est un outil dédié à l'analyse et à la visualisation de données génétiques, notamment pour l'identification et la cartographie de loci de caractères quantitatifs (QTL). Il permet aux chercheurs en génétique et en biologie végétale ou animale de modéliser, comparer et visualiser des données issues de différentes cartes génétiques afin d'identifier des régions génomiques associées à des traits d'intérêt.

Ce projet est une plateforme dédiée à la collecte, l'analyse et la gestion de données scientifiques sur les spermophiles (rongeurs terrestres). Il permet aux chercheurs de suivre les populations, d'étudier les comportements, les paramètres physiologiques et les interactions sociales des animaux. L'outil facilite également la génération de rapports et l'export de données pour des analyses approfondies.

Le projet peladsm est un package R dédié à l'analyse et la modélisation des dynamiques des populations animales face aux changements climatiques. Il permet aux chercheurs en écologie et en biostatistique de disposer d'un ensemble d'outils et de méthodes pour l'analyse des données environnementales et la modélisation de la dynamique des populations animales.