Annuaire des initiatives
Pertinence
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- Le package provoc a été développé pour prendre en charge les utilisateurs de PTR-ToF-MS dans leurs analyses. Il a été conçu pour une importation rapide des données dans R et la visualisation des premiers résultats en quelques minutes. Il détecte automatiquement les pics et fournit une matrice pour une analyse ultérieure. Il propose également quelques fonctions de chimie métrique.
- Outil de caractérisation des composés chimiques développé par l'INERIS pour répondre à trois besoins : l'identification de substances dans des prélèvements aqueux, l'identification de sources de pollution environnementales et la caractérisation de sources de pollution de l'air. L'outil est basé sur une plateforme web qui utilise des modèles d'intelligence artificielle pour analyser les données et fournir des résultats.
- Ce projet vise à fournir des scripts permettant de prétraiter et d'analyser des données de séquençage de l'océan. Il permet de nettoyer et de dénommer les séquences à l'aide de l'algorithme dada2, de fusionner les tables de séquences de plusieurs échantillons et d'éliminer les séquences chimériques.
- Le package rchemo est un outil dédié à l'exploration et à la prédiction de données, avec un focus sur les données à haute dimension et la chimométrie. Il a été initialement conçu pour les modèles de régression et de discrimination PLS (Partial Least Squares) et leurs variantes, avant d'être étendu à de nombreuses autres méthodes pour l'analyse de données à haute dimension.
- IPANEMAP est un logiciel d'analyse de la structure et de la réactivité de l'ARN qui permet de prédire les structures secondaires stables compatibles avec plusieurs profils de réactivité de sondage chimique (SHAPE, DMS, enzymatique...). Il prend en entrée une ou plusieurs séquences d'ARN et plusieurs profils de réactivité, et génère en sortie une ou plusieurs structures secondaires, correspondant aux conformères les mieux soutenus par les données expérimentales et la thermodynamique.
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