Deep Finder est un outil d'analyse d'images développé pour aider les scientifiques à identifier et à classer des structures protéiques dans des données de microscopie cryo-électronique. Il est basé sur des algorithmes de deep learning et offre une interface graphique conviviale pour faciliter son utilisation. Deep Finder a été testé avec succès sur des données de tomographie cryo-électronique et a démontré une grande précision dans la détection et la segmentation de structures cellulaires.

Nabu est un logiciel open source dédié au traitement et à la reconstruction d'images tomographiques, principalement utilisé dans le domaine de la recherche scientifique. Il permet aux chercheurs d'analyser des données issues de techniques d'imagerie avancées comme la tomographie aux rayons X, facilitant ainsi la compréhension de structures complexes à l'échelle microscopique ou macroscopique.

Nxtomomill est une suite d'outils et d'applications dédiés à la gestion du format NXtomo, un standard défini par la communauté NeXus. Il permet de convertir des données brutes issues de différents instruments scientifiques (comme ceux de l'ESRF) en fichiers NXtomo, d'éditer ces fichiers ou d'en créer de nouveaux via une API Python. Ces outils facilitent l'interopérabilité et l'analyse des données de tomographie.

Outil dédié au traitement et à l'analyse de données issues de la diffraction des rayons X, notamment pour la tomographie par contraste de diffraction (XRD-CT). Il permet d'effectuer des intégrations azimuthales sur des jeux de données complexes, facilitant ainsi l'analyse cristallographique et la reconstruction d'images 3D. Utilisé principalement dans le domaine de la recherche scientifique et des grands instruments comme les synchrotrons.

ETFScan est un outil Python dédié à la conversion et à la manipulation de fichiers ETF, un format utilisé pour stocker des données de scan issues de techniques expérimentales comme la tomographie. Il permet de transformer des fichiers Nexus ou BLISS en format ETF, et de combiner plusieurs scans ETF en un seul fichier. Principalement utilisé dans le domaine de la recherche scientifique, il facilite l'analyse et le traitement des données collectées lors d'expériences.

Bibliothèque open source dédiée à l'accès, la lecture et l'écriture de données de tomographie issues d'acquisitions expérimentales. Elle permet de manipuler des volumes de données scientifiques dans différents formats (HDF5, JP2K, TIFF, EDF) et facilite leur traitement pour des applications en imagerie et analyse de matériaux.

Outil open source dédié au traitement et à l'analyse d'images scientifiques, notamment dans les domaines de la tomographie et de l'imagerie médicale. Il permet aux chercheurs et ingénieurs de manipuler, visualiser et analyser des jeux de données volumineux avec des algorithmes avancés. Intégré à des environnements de calcul scientifique, il facilite la reproductibilité et l'automatisation des analyses.

EBS-Tomo est un framework open source dédié à la tomographie rapide, conçu pour analyser des données issues de scans 3D. Il permet aux chercheurs et ingénieurs de traiter des images médicales, industrielles ou scientifiques avec des outils avancés de reconstruction et d'analyse. Intégré à l'écosystème BLISS, il facilite la simulation, l'optimisation et le partage de protocoles expérimentaux, notamment dans des environnements comme l'ESRF.

Bibliothèque et outil open source dédié au traitement et à l'analyse d'images 3D issues de scanners à tomographie. Il permet de manipuler, transformer et analyser des volumes d'images médicales ou scientifiques avec des algorithmes parallélisés et optimisés. Le projet inclut également des outils pour distribuer les calculs sur des clusters, facilitant le traitement de grands jeux de données.

DCT est un outil dédié à la tomographie par contraste de diffraction, permettant de reconstruire les formes et orientations des grains cristallins à partir de données expérimentales. Il offre des pipelines de traitement avancés, des outils d'analyse interactive et des fonctionnalités de visualisation pour les chercheurs en science des matériaux et cristallographie. Le projet est utilisé dans des environnements de recherche comme l'ESRF pour des applications en métallurgie et science des matériaux.