Annuaire des initiatives

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  • Ce projet automatise la récupération, la transformation et l'intégration de données biochimiques issues de bases de données spécialisées (comme KEGG ou BRENDA). Il permet de convertir des fichiers de données métaboliques, enzymatiques ou réactionnelles entre différents formats (ODS, TXT, SBML) et d'enrichir des modèles de voies métaboliques avec des informations thermodynamiques et cinétiques. Les outils développés facilitent l'analyse des réactions biochimiques et l'étude des enzymes pour la recherche en biologie systémique.
  • Bibliothèque Python dédiée à la modélisation et à l'ajustement de spectres en équilibre thermodynamique local (LTE). Elle permet aux chercheurs en astrophysique d'analyser des données spectrales, de simuler des raies moléculaires et de comparer des modèles théoriques avec des observations réelles. L'outil s'intègre dans l'écosystème CASSIS, facilitant l'interprétation des spectres issus de milieux interstellaires ou circumstellaires.
  • IPANEMAP est un logiciel d'analyse de la structure et de la réactivité de l'ARN qui permet de prédire les structures secondaires stables compatibles avec plusieurs profils de réactivité de sondage chimique (SHAPE, DMS, enzymatique...). Il prend en entrée une ou plusieurs séquences d'ARN et plusieurs profils de réactivité, et génère en sortie une ou plusieurs structures secondaires, correspondant aux conformères les mieux soutenus par les données expérimentales et la thermodynamique.

3 initiatives