Ce module est destiné aux scientifiques souhaitant s'approprier les bases de la statistique descriptive et inférentielle. Il vise une initiation à la résolution de problème par une approche stochastique. Les concepts d'analyse des données, d'estimation et tests, d'analyse de la variance et de régression seront abordés d'un point de vue pratique.

Le package R VarExp fournit des fonctions pour l'estimation de la variance phénotypique expliquée par des effets génétiques, interactionnels ou conjointement par ces deux effets. Ces fonctions sont utiles pour les designs de méta-analyse où la mise en commun des données génétiques individuelles est difficile.

EPeak est un workflow snakemake-based pour l'analyse de données ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag à partir de fichiers FASTQ bruts. Il permet de streamliner des étapes critiques telles que l'évaluation de la qualité de l'immunoprécipitation à l'aide de la corrélation croisée et la comparaison des réplicats pour les pics étroits et larges. Pour l'analyse différentielle, ePeak fournit des méthodes linéaires et non linéaires pour la normalisation entre échantillons ainsi que des modèles conservateurs et stricts pour l'estimation de la variance et le test de la significativité des différences observées.

Linmodel est une application shiny en français permettant de faciliter la réalisation de certaines analyses statistiques : régression linéaire, analyse de variance, test de Kruskal-Wallis et test de Friedman.

Outil d'analyse de covariances conditionnelles entre prédicteurs, permettant de détecter les différences de covariances en contrôlant les effets de moyenne et de variance.