Ce projet est un outil d'analyse de données de vols aériens développé dans le cadre d'un module de programmation avancée. Il permet aux utilisateurs d'interroger une base de données contenant des informations sur les compagnies aériennes, les aéroports et les vols. Les fonctionnalités incluent le calcul de durées moyennes de vols, l'identification des compagnies ou vols les plus retardataires, et la recherche d'itinéraires entre aéroports. L'outil est conçu pour être utilisé en ligne de commande avec des requêtes personnalisées.

Outil en ligne de commande conçu pour évaluer et comparer les performances de différents parseurs de code Fortran sur une base de code donnée. Il génère des statistiques et des résultats détaillés pour aider les développeurs à choisir l'outil le plus adapté à leurs besoins. Le projet inclut des analyses sur des bases de code réelles comme DYNAMICO, LMDZ ou ORCHIDEE, fournissant des métriques précises sur la couverture et l'efficacité des parseurs.

Csv-detective-ml est un outil en ligne de commande permettant d'analyser des fichiers CSV et de détecter automatiquement les types de données contenus dans chaque colonne. Cet outil est basé sur des algorithmes de machine learning et permet de nettoyer et de préparer rapidement des données en vue de leur utilisation dans des analyses ou des modèles prédictifs.

CRISPRbact est une bibliothèque Python et un outil en ligne de commande dédié à la conception et l'analyse d'expériences CRISPRi (interférence) dans les bactéries. Il permet de prédire l'efficacité des ARN guides pour bloquer l'expression génique, de concevoir des bibliothèques optimisées couvrant des génomes bactériens entiers, et d'évaluer la couverture de bibliothèques existantes. L'outil s'appuie sur des modèles entraînés sur des données expérimentales massives pour maximiser la précision des prédictions.

DeCovA est un outil en ligne de commande écrit en Perl qui permet d'analyser la couverture de séquençage d'ADN et de détecter des variations du nombre de copies (CNV). Il prend en entrée des fichiers BAM et une annotation génomique et produit des graphiques et des fichiers de sortie contenant des informations sur la profondeur de couverture et les CNV.

Outil en ligne de commande conçu pour appliquer la liste noire ENCODE à des fichiers BED. Il permet de supprimer les régions génomiques problématiques dans les analyses de séquençage haut débit, notamment pour les expériences ChIP-seq. Le script prend en charge plusieurs génomes de référence (hg19, hg38, mm10) et permet l'utilisation de listes noires personnalisées. Il est optimisé pour une intégration dans des pipelines bioinformatiques et offre des fonctionnalités comme la gestion des fichiers compressés ou l'expansion des marges des régions problématiques.

Le Genome Analysis Toolkit (GATK) est un ensemble d'outils en ligne de commande permettant d'analyser des données de séquençage haut débit, avec un accent particulier sur la découverte de variations. Les outils peuvent être utilisés individuellement ou enchaînés dans des workflows complets. Ce dépôt contient une version spécifique de GATK (4.1.4.1) installée dans un environnement Miniconda3 et empaquetée dans un conteneur Singularity.

Ce projet pédagogique vise à enseigner aux élèves comment analyser et modifier des fichiers exécutables binaires ou objets. Les participants apprennent à manipuler des programmes compilés en C, à comprendre leur structure en hexadécimal et à en changer le comportement, comme modifier un mot de passe en clair ou altérer des opérations arithmétiques. L'objectif est de familiariser avec les outils de ligne de commande et les concepts de bas niveau en informatique.

Ce projet est une application en ligne de commande conçue pour analyser les données de vols aériens aux États-Unis en 2014. Il permet aux utilisateurs d'effectuer des requêtes avancées sur les vols, les compagnies aériennes et les aéroports via un terminal. L'application offre des fonctionnalités comme la recherche d'itinéraires, le calcul de retards moyens, ou encore l'identification des vols les plus retardés. Les données sont chargées depuis des fichiers CSV et traitées en temps réel.

Ce projet est une application en ligne de commande conçue pour analyser les données de vols aux États-Unis en 2014. Il permet de charger des fichiers CSV contenant des informations sur les aéroports, les compagnies aériennes et les vols, puis d'effectuer des requêtes pour extraire des données spécifiques comme les vols retardés, les itinéraires entre aéroports ou les compagnies les plus impactées par les retards. L'objectif est de fournir une analyse approfondie des performances des vols et des compagnies aériennes.