Outil dédié à l'analyse et à la modélisation de séquences, notamment pour les données biologiques ou temporelles. Permet de calculer des alignements, des distances, des probabilités, et de générer des visualisations comme des graphiques ou des tableaux. Utilisé pour étudier des phénomènes répétitifs, des chaînes de Markov, ou des processus de renouvellement dans divers domaines scientifiques.

DeXtrusion est une solution logicielle basée sur l'intelligence artificielle conçue pour analyser des séquences vidéo de tissus épithéliaux. Elle permet de détecter automatiquement des événements cellulaires dynamiques comme les extrusions, divisions ou mort cellulaire, en générant des cartes de probabilité et des localisations spatio-temporelles précises. Utilisable par des biologistes ou chercheurs en imagerie cellulaire, elle facilite l'étude des mécanismes cellulaires sans expertise en programmation.

Outil dédié à l'analyse d'images biologiques permettant de corriger les décalages chromatiques et les dérives temporelles (translations et rotations) dans les séquences d'images. Basé sur la corrélation spectrale, il s'intègre comme un plugin au logiciel Icy, développé par l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur. Il facilite l'alignement précis des images pour des analyses reproductibles et fiables.

Outil dédié à l'analyse d'images de microscopie permettant d'extraire des kymographes, représentations graphiques de l'évolution de l'intensité lumineuse le long d'un chemin défini dans une séquence d'images temporelles. Il facilite le traçage de trajectoires de particules, l'analyse de mouvements bidirectionnels et l'export des résultats pour une visualisation ou une analyse complémentaire dans d'autres logiciels.

Extension pour le logiciel Icy dédiée à l'analyse d'images bio-médicales. Elle permet de gérer, visualiser et analyser des trajectoires d'objets détectés dans des séquences d'images. Le plugin facilite le suivi de particules, la sélection temporelle ou par régions d'intérêt, et propose des outils pour calculer des graphiques de flux locaux ou polaires. Utilisé principalement en recherche biologique et médicale.

Outil dédié à la création de kymographes pour analyser les mouvements de régions d'intérêt dans des séquences d'images, notamment dans le cadre de l'étude du développement biologique. Il permet de tracer des rectangles sur des images ou vidéos, puis de générer une représentation graphique de l'évolution temporelle de l'intensité lumineuse le long d'un axe. Utilisé principalement en recherche biomédicale pour visualiser des dynamiques cellulaires ou moléculaires.

Outil d'analyse dédié à la détection et à la mesure des bulles de gaz dans les vidéos aériennes du lac Dziani à Mayotte. Le projet traite des séquences vidéo capturées par drone pour identifier les panaches de bulles, calculer leurs positions et interpoler les données temporelles. Les résultats permettent d'étudier les dynamiques environnementales et les émissions de gaz dans ce milieu lacustre unique.

Projet dédié à l'analyse automatisée du comportement de larves de drosophile. Il permet de classifier des séquences temporelles de mouvements en catégories comportementales précises (comme courir, se rouler, s'arrêter) à l'aide de modèles d'apprentissage automatique. Le système génère également des représentations vectorielles des données pour des analyses comparatives ou des visualisations.

Outil dédié à la gestion et à l'analyse des chronologies pour la mission MAJIS, permettant de manipuler, convertir et exporter des fichiers de planification (ITL, CSV, XLSM). Il facilite la création, l'édition et l'analyse des séquences temporelles pour les observations scientifiques, en intégrant des fonctionnalités de calcul de temps relatifs et absolus.

Plugin pour le logiciel Icy dédié à l'analyse d'images biologiques. Il permet de traiter et d'extraire des séquences temporelles de trajectoires de particules ou d'objets biologiques, facilitant ainsi l'étude dynamique des phénomènes cellulaires ou moléculaires. Utilisé principalement en recherche biomédicale pour des applications comme le suivi de cellules ou de molécules.