DeCovA est un outil en ligne de commande écrit en Perl qui permet d'analyser la couverture de séquençage d'ADN et de détecter des variations du nombre de copies (CNV). Il prend en entrée des fichiers BAM et une annotation génomique et produit des graphiques et des fichiers de sortie contenant des informations sur la profondeur de couverture et les CNV.

DeepSTR est un projet d'analyse et de prédiction de l'impact fonctionnel des variations du génome, en particulier les variations répétitives (STR). Il inclut des algorithmes de machine learning et de fouille de données pour détecter des motifs dans les séquences d'ADN et prédire leur impact sur la régulation génique.

Genometools est un projet dédié à l'analyse de données génomiques. Il permet l'identification de variations génétiques et la recherche de motifs dans des séquences d'ADN, offrant ainsi des fonctionnalités clés pour la recherche en génomique.

Mummer est un projet dédié à l'analyse de données génomiques, avec une spécialisation dans l'alignement de séquences d'ADN et la détection de variations structurales. Il permet aux chercheurs en génomique de comparer des séquences d'ADN et d'identifier les similitudes et les différences entre elles, ce qui facilite la compréhension de l'évolution des génomes et l'identification de mutations responsables de maladies.

Le projet gattlab est une plateforme dédiée à l'analyse de données génomiques. Il permet la recherche de variations génétiques, le développement d'outils de bio-informatique et la gestion de workflows de génomique. Il offre des fonctionnalités avancées pour les chercheurs et professionnels du domaine de la génomique.

Ce projet permet la détection de variations génétiques et l'analyse de données génomiques grâce à des méthodes statistiques. Il propose également une visualisation claire des résultats grâce à des graphiques et des représentations adaptées.

Rsamtools_graph est un projet dédié à l'analyse et la visualisation de données génomiques. Il permet d'étudier les interactions entre gènes et de détecter des variations structurales dans les génomes.

Outil d'analyse de variations génomiques permettant de localiser les positions de variants sur le génome, de vérifier leur présence sur des régions annotées et de déterminer la fonction protéique des gènes associés.

DiscoSnp++ est un outil d'analyse génomique permettant la détection de variations génétiques, telles que les SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) et les indels (insertions et délétions), à partir de jeux de données brutes de lectures. Il ne nécessite pas de génome de référence et peut traiter plusieurs jeux de lectures simultanément.

R_QTLseqr est un projet en cours de développement visant à fournir des outils pour l'analyse de données génomiques et la détection de variations génétiques. Il permettra de rechercher des liens entre le génotype et le phénotype, offrant ainsi de nouvelles perspectives pour la recherche biomédicale.