Ce projet automatise l'extraction et la structuration des informations médicales contenues dans les Résumés des Caractéristiques du Produit (RCP) des médicaments. Il permet de transformer des fichiers HTML en données exploitables pour des analyses statistiques, des rapports ou des intégrations dans des pipelines de données. L'objectif est de faciliter l'accès et l'exploitation des données réglementaires des médicaments pour les professionnels de santé ou les organismes publics.

BioAutoMATED est une plateforme d'apprentissage automatique (AutoML) dédiée à l'analyse de séquences biologiques. Elle intègre plusieurs méthodes AutoML dans un cadre unifié, offrant aux utilisateurs des techniques pertinentes pour l'analyse, l'interprétation et la conception de séquences biologiques. BioAutoMATED permet de prédire la régulation des gènes, les interactions peptide-médicament et l'annotation des glycanes avec une performance comparable à celle de modèles manuellement ajustés, mettant en évidence les caractéristiques séquentielles saillantes. En automatisant la modélisation des séquences, BioAutoMATED permet aux scientifiques de la vie de plus facilement intégrer l'apprentissage machine dans leur travail.

Outil de traitement et d'analyse d'images biologiques intégré au logiciel Icy. Permet de créer des chaînes de modules pour automatiser des analyses d'images, notamment pour l'extraction de caractéristiques, la segmentation ou le traitement de régions spécifiques. Utilisé principalement dans le domaine de la bio-imagerie pour des applications en recherche médicale ou biologique.

Boîte à outils dédiée à l'analyse d'images biologiques et médicales, intégrée au logiciel Icy. Elle fournit des fonctionnalités avancées pour le traitement, la segmentation et l'extraction de caractéristiques d'images, facilitant ainsi la recherche en bio-imagerie. Utilisée par des scientifiques pour automatiser des analyses complexes et améliorer la reproductibilité des résultats.

La base RAC est une base de données exhaustive sur les dépenses de santé et les restes à charge après remboursement par l'Assurance maladie obligatoire en France. Elle permet d'analyser la répartition des dépenses médicales, d'évaluer l'impact des politiques de santé et de produire des indicateurs pour les décideurs publics. Les données couvrent l'ensemble des consommants de soins en ville et à l'hôpital, avec des détails sur les montants remboursés, les restes à charge et les caractéristiques des patients.

Module logiciel dédié à l'extraction automatique de caractéristiques à partir d'images, notamment pour des applications en télédétection et imagerie médicale. Il permet d'identifier, quantifier et analyser des éléments spécifiques dans des images complexes, facilitant ainsi la prise de décision dans des domaines comme l'agriculture de précision, la gestion des risques naturels ou l'urbanisme. Intégré à l'Orfeo ToolBox (OTB), il offre des outils avancés pour le traitement et l'interprétation de données visuelles.

BioGITOM est un système spécialisé dans l'alignement d'ontologies biomédicales, essentielles pour organiser et standardiser les connaissances médicales. Il combine des embeddings sémantiques spécifiques au domaine avec des caractéristiques structurelles issues d'un modèle hybride (Graph Isomorphism Transformer). Cette approche permet de générer des représentations précises des concepts et d'améliorer l'intégration des données entre différentes ontologies, facilitant ainsi la recherche et l'analyse en santé.

Ce projet développe un modèle d'ensemble de classifieurs monotones bidimensionnels pour analyser des données médicales ou comportementales. Il permet de prédire des risques (comme le cancer du col de l'utérus) en utilisant des données tabulaires pré-traitées. Le modèle intègre une sélection préalable de paires de caractéristiques pour optimiser les performances et réduire significativement le temps de calcul par rapport aux approches existantes.

Ce projet est dédié à l'extraction, la transformation et le chargement (ELT) de données démographiques concernant les professionnels de santé. Il permet d'agréger et d'analyser des informations essentielles pour mieux comprendre la répartition et les caractéristiques des acteurs du secteur médical.