BioGITOM est un système spécialisé dans l'alignement d'ontologies biomédicales, essentielles pour organiser et standardiser les connaissances médicales. Il combine des embeddings sémantiques spécifiques au domaine avec des caractéristiques structurelles issues d'un modèle hybride (Graph Isomorphism Transformer). Cette approche permet de générer des représentations précises des concepts et d'améliorer l'intégration des données entre différentes ontologies, facilitant ainsi la recherche et l'analyse en santé.