La plateforme Vidjil est composée de deux parties principales : Vidjil-algo et une application web. Vidjil-algo analyse les données de séquençage à haut débit pour extraire les jonctions V(D)J et les regrouper en clones. L'application web permet la visualisation et l'analyse interactive des clones et de leur évolution dans le temps dans un contexte de suivi de la maladie résiduelle minimale ou d'étude immunologique. Elle peut également être liée à une base de données de échantillons, d'expériences et de patients pour le stockage des données et des métadonnées, l'exécution de logiciels RepSeq et la sauvegarde d'annotations directement depuis l'application web.

La plateforme Vidjil est composée de deux parties principales : Vidjil-algo et une application web. Vidjil-algo permet d'extraire des jonctions V(D)J et de les regrouper en clones à partir de données de séquençage à haut débit. L'application web permet la visualisation et l'analyse interactives des clones et de leur suivi dans le temps dans un contexte de suivi de la maladie résiduelle minimale ou d'étude immunologique. Elle peut être liée à une base de données de échantillons, d'expériences et de patients permettant le stockage de données et de métadonnées séquence, l'exécution de logiciels RepSeq et la sauvegarde d'annotations directement depuis l'application web.

Outil bioinformatique automatisé pour l'analyse de données de séquençage haut débit (CUT&Tag et DAP-Seq). Il permet d'identifier les régions génomiques liées à des protéines spécifiques, d'annoter ces régions, de comparer les profils d'expression entre échantillons et de visualiser les résultats dans des navigateurs génomiques comme IGV. Destiné principalement à la recherche en biologie végétale et génomique fonctionnelle.

Projet dédié à la mise à disposition et à la valorisation des jeux de données issus de l'édition Karbowsky de l'INHA. Il documente les décors de l'hôtel particulier de Jacques Doucet, situé rue Spontini à Paris, conçus par Adrien Karbowsky. Les données incluent des manifestes IIIF, des annotations, des photographies d'époque et des catalogues d'œuvres et de personnes liées aux collections de Doucet.

Base de données médicale open data dédiée à l'analyse d'images de lames microscopiques de biopsies cervicales et de spécimens chirurgicaux. Elle fournit des images haute résolution, des métadonnées associées et des annotations pour faciliter la détection de lésions. Destinée aux chercheurs et participants de défis de données, elle est accessible librement pour promouvoir l'innovation en imagerie médicale.

Ce projet propose un jeu de données dédié à la segmentation des vaisseaux du foie, issu de travaux de recherche menés par l'Inria. Il permet aux chercheurs et développeurs en imagerie médicale d'accéder à des données annotées pour entraîner et évaluer des modèles d'intelligence artificielle. Ces données sont essentielles pour améliorer les outils de diagnostic et de traitement des maladies hépatiques.

Ce projet est un tutoriel pratique dédié à la segmentation discursive et à l'analyse des relations de discours dans des textes. Il s'adresse principalement aux étudiants et chercheurs en linguistique ou traitement automatique des langues (TAL). Le projet propose des séances théoriques et pratiques pour apprendre à utiliser des outils avancés comme ToNy ou DisCut, évaluer des prédictions automatiques, et améliorer des modèles de segmentation discursive à partir de données annotées.

Le projet srcmf-ud est un outil dédié au traitement de données linguistiques, plus spécifiquement à l'annotation de texte selon les normes Universal Dependencies (UD). Il permet d'analyser des corpus et d'y apposer une annotation UD, facilitant ainsi l'exploitation et l'analyse de ces données pour des applications en linguistique computationnelle.

Ce projet automatise l'identification et l'extraction des titres de chansons (airs) présents dans des textes dramatiques français, notamment des pièces de théâtre. Il analyse des corpus annotés manuellement pour proposer des titres de chansons en utilisant des méthodes de correspondance de chaînes et de recherche sémantique. Les résultats sont exportés sous forme de fichiers structurés pour une utilisation ultérieure dans des bases de données ou des analyses littéraires.

Le projet anr_eclats_wp4 vise à développer des outils d'annotation linguistique pour l'analyse de données linguistiques. Il comprend deux livrables principaux : ShinyDialect et ShinyClass.