Outil bioinformatique automatisé pour l'analyse de données de séquençage haut débit (CUT&Tag et DAP-Seq). Il permet d'identifier les régions génomiques liées à des protéines spécifiques, d'annoter ces régions, de comparer les profils d'expression entre échantillons et de visualiser les résultats dans des navigateurs génomiques comme IGV. Destiné principalement à la recherche en biologie végétale et génomique fonctionnelle.

Ce projet permet de détecter et corriger les erreurs d'annotation dans les domaines protéiques de génomes de primates et de champignons. Il compare les protéomes orthologues pour identifier les incohérences et améliorer la précision des annotations fonctionnelles des protéines.

Ensemble d'outils pour l'analyse des données métaprotéomiques générées par des instruments de spectrométrie de masse de haute throughput. Ces outils permettent de regrouper les abondances de peptides et protéines, exprimées en comptages spectraux, et de les manipuler en groupes de métaprotéines. Les informations obtenues peuvent être représentées à l'aide de fonctions de visualisation multiples pour afficher le paysage métaprotéomique global et différencier les échantillons ou conditions en termes d'abondance de métaprotéines, de niveaux taxonomiques et/ou d'annotation fonctionnelle.

Ce projet est une ressource pédagogique dédiée à l'apprentissage et à la pratique de la programmation fonctionnelle. Il propose un environnement simple pour compiler et exécuter des programmes écrits en OCaml, un langage de programmation fonctionnel. Idéal pour les étudiants ou les développeurs souhaitant se familiariser avec ce paradigme.