metaprotr
Ensemble d'outils pour l'analyse des données métaprotéomiques générées par des instruments de spectrométrie de masse de haute throughput. Ces outils permettent de regrouper les abondances de peptides et protéines, exprimées en comptages spectraux, et de les manipuler en groupes de métaprotéines. Les informations obtenues peuvent être représentées à l'aide de fonctions de visualisation multiples pour afficher le paysage métaprotéomique global et différencier les échantillons ou conditions en termes d'abondance de métaprotéines, de niveaux taxonomiques et/ou d'annotation fonctionnelle.
Cas d'utilisation métiers
- Différenciation des échantillons ou conditions en fonction de l'abondance des métaprotéines : rechercher des initiatives proches
- Analyse de données métaprotéomiques : rechercher des initiatives proches
- Regroupement de peptides et protéines en métaprotéines : rechercher des initiatives proches
- Visualisation de l'abondance des métaprotéines : rechercher des initiatives proches
Organisation
- Centres de recherche régionaux de l'INRAE (organisation rattachée)
Description générée le lundi 18 mars 2024 à 11:08:57
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