Ce projet vise à faciliter la mise en place et l'utilisation de workflows bioinformatiques en utilisant des containers pour le déploiement d'applications. Il permet également l'automatisation de pipelines de traitement de données, ce qui permet de gagner du temps et de réduire les erreurs.

Ce projet fournit un dépôt de code source contenant des modules Snakemake réutilisables et interopérables, permettant l'automatisation de workflows bioinformatiques et la gestion de pipelines de données.

Ce projet fournit un dépôt de code source contenant des modules Snakemake réutilisables et interopérables, permettant l'automatisation de workflows bioinformatiques et la gestion de pipelines de données.

CELIA est un workflow bioinformatique utilisé pour automatiser les assemblages de génomes de procaryotes à partir de données Illumina. Il permet de faire un contrôle qualité des données, d'assembler le génome, de rechercher des contaminants, d'évaluer la qualité de l'assemblage, de faire une annotation structurale et de rechercher des antibiotiques et des métabolites secondaires.