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Pertinence
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- Le projet NPB (NAS Parallel Benchmarks) est une suite de programmes conçus pour évaluer les performances des supercalculateurs et des systèmes parallèles. Développé par la NASA, il permet de mesurer l'efficacité des architectures informatiques en simulant des charges de travail intensives. Les benchmarks couvrent divers domaines comme le calcul scientifique, la dynamique des fluides ou le traitement de données massives. Les résultats obtenus aident les chercheurs et ingénieurs à optimiser leurs configurations matérielles et logicielles.
- Ce projet fournit un cadre de scripts conçu à l'origine pour exécuter des benchmarks de BLAST et PLAST sur une infrastructure informatique de cluster. Les scripts sont adaptés pour fonctionner avec le système de planification des tâches PBS pro 14.2.4, BLAST 2.2.31 et 2.6.0, et PLAST 2.3.2. Ils ont été utilisés pour évaluer la configuration optimale (coeurs, RAM et walltime) pour l'exécution de tâches de comparaison de séquences (utilisant BLAST ou PLAST) sur le superordinateur DATARMOR d'IFREMER.
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