Le projet dnabushmeat est un outil dédié à l'analyse de séquences d'ADN, permettant le calcul de similarités entre séquences et la gestion de workflows de bio-informatique. Il s'appuie sur des outils tels que SGE, Python, R, BLAST, Clustal et Muscle.

Outil d'alignement de séquences d'ADN permettant la visualisation d'alignements multiples et le calcul de similarité entre séquences.

OGRI est un ensemble d'outils en ligne de commande écrits en Bash permettant de calculer des mesures de similarité entre génomes. Les mesures de similarité sont basées sur des alignements locaux de séquences et comprennent l'identité nucléotidique moyenne (ANI), l'identité de protéines (AAI), le pourcentage de gènes conservés (POCP) et le pourcentage d'acides aminés identiques (ProCov).