Melissa est un cadre évitant les fichiers, tolérant aux pannes et élastique pour effectuer une analyse de sensibilité à grande échelle sur des supercalculateurs. Il traite les données en ligne, évitant ainsi le stockage intermédiaire de fichiers et permettant des études à grande échelle avec des millions de simulations parallèles. Melissa est construit autour de deux concepts clés : les algorithmes statistiques itératifs et le modèle asynchrone client/serveur pour le transfert de données.

CLARI-TE_smk est un pipeline Snakemake pour l'annotation génomique à grande échelle de TEs de génomes *Triticeae* basé sur RepeatMasker et CLARI-TE. Il est conçu pour fonctionner sur un cluster HPC avec slurm et effectue des calculs distribués pour annoter simultanément les TEs de différents chromosomes d'un génome. Il crée finalement un fichier d'annotation gff3.