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Pertinence
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- Ce projet est un modèle pour les workflows Get, permettant l'exécution de pipelines bioinformatiques à partir d'un fichier samples.csv, en utilisant des images Singularity ou Conda, avec la possibilité de tracer les versions des logiciels, d'envoyer un email de notification à la fin du pipeline, et de générer automatiquement une image Singularity.
- Ce bot permet de surveiller les mises à jour de services et d'envoyer des notifications sur Mattermost. Il utilise les API des forges logicielles ou un flux RSS pour récupérer la liste des versions. Le bot est régulièrement exécuté grâce à supercronic et la liste des sources à surveiller peut être modifiée dans le fichier feeds.yaml.
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