template-nf
Notoriété 15 %
Ce projet est un modèle pour les workflows Get, permettant l'exécution de pipelines bioinformatiques à partir d'un fichier samples.csv, en utilisant des images Singularity ou Conda, avec la possibilité de tracer les versions des logiciels, d'envoyer un email de notification à la fin du pipeline, et de générer automatiquement une image Singularity.
Dépôt de code
Cas d'utilisation métiers
- Envoi d'emails de notification : rechercher des initiatives proches
- Gestion des dépendances logicielles avec Singularity ou Conda : rechercher des initiatives proches
- Exécution de pipelines bioinformatiques : rechercher des initiatives proches
- Génération de rapports avec MultiQC : rechercher des initiatives proches
Cas d'utilisation fonctionnel
Organisation
- Centres de recherche régionaux de l'INRAE (organisation rattachée)
Description générée le mardi 19 mars 2024 à 15:54:14
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