Annuaire des initiatives
Pertinence
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- Ce projet est une formation pratique sur le text-mining et la reconnaissance d'entités nommées (REN) à partir de textes scientifiques. Les participants apprennent à utiliser AlvisNLP, un outil de composition de workflows en text-mining développé par l'équipe Bibliome de l'unité MaIAGE, pour effectuer une première approche de l'application de text-mining. La formation s'adresse à des chercheurs et ingénieurs en informatique ou en maths-info-stats appliquées ou en bioinformatique.
- Ce projet est une formation en ligne proposée par l'Institut Pasteur qui vise à enseigner l'utilisation de Linux et de la bioinformatique pour l'analyse de séquences du SARS-CoV-2. Les participants apprendront à utiliser des outils et des méthodes pour analyser les données de séquençage du virus et contribuer à la recherche médicale.
- Ce projet vise à fournir une plateforme centralisée pour la formation en nanopore en Amérique latine. Il comprend des présentations, des documents, des protocoles et des carnets de notes bioinformatiques pour aider les chercheurs et les professionnels de la santé à comprendre et à utiliser cette technologie émergente.
- Ce projet est un cours de formation sur les pratiques équitables en bioinformatique. Il est organisé en 7 notebooks Jupyter qui couvrent des sujets tels que les concepts de reproductibilité, l'utilisation de Git pour le partage de code et l'historique de fichiers, l'introduction à Conda, l'utilisation du cluster BiRD, l'introduction aux workflows Snakemake, et la description d'autres outils intéressants pour la reproductibilité.
- Karyoplot est un package python permettant de dessiner des karyoplots/idéogrammes simples à partir de fichiers de données cytogénétiques conventionnels (tels que .bed, .fasta, .gff, .gtf, .vcf, etc.) sans avoir besoin de manipulations de fichiers préalables. Il est basé sur matplotlib pour le rendu des graphiques et pysam pour l'analyse des formats de fichiers bioinformatiques.
- Notoriété 86 %Ce site officiel, développé par le Ministère de l'Intérieur, accompagne les étrangers détenteurs d'un titre de séjour en France dans leur parcours d'intégration. Il propose des ressources pédagogiques pour comprendre les principes et valeurs de la République, les démarches administratives essentielles, et se préparer à l'examen civique obligatoire. Le site facilite l'accès à des fiches thématiques et des repères concrets pour mieux s'installer et s'intégrer dans la société française.
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