karyoplot
Karyoplot est un package python permettant de dessiner des karyoplots/idéogrammes simples à partir de fichiers de données cytogénétiques conventionnels (tels que .bed, .fasta, .gff, .gtf, .vcf, etc.) sans avoir besoin de manipulations de fichiers préalables. Il est basé sur matplotlib pour le rendu des graphiques et pysam pour l'analyse des formats de fichiers bioinformatiques.
Cas d'utilisation métiers
Organisation
- Centres de recherche régionaux de l'INRAE (organisation rattachée)
Description générée le mardi 19 mars 2024 à 16:06:24
D'autres initiatives de la même organisation
- osrmgithub.com/riatelab/osrm
- support-de-formationforgemia.inra.fr/git-gitlab-paca/support-de-formation
- gustavegithub.com/InseeFr/gustave
- metagWGSforgemia.inra.fr/genotoul-bioinfo/metagwgs