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Pertinence
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- Le projet statistics-crawler est une application web permettant de collecter des données statistiques à partir de sites web définis, de les analyser et de générer des rapports à partir de ces données. Il est basé sur le framework Scrapy pour la collecte de données, Pandas pour l'analyse de données et Matplotlib pour la génération de graphiques.
- Ce projet vise à comparer plusieurs outils permettant d'identifier les cytosines méthylées dans des données fast5. Après avoir exécuté ces outils sur un jeu de données test d'Arabidopsis thaliana, une analyse comparative a été réalisée en termes de détection par sites. Il a été conclu que DeepSignalPlant était le plus performant. Ce dépôt contient des scripts permettant d'exécuter DeepSignalPlant et de générer des statistiques à partir de ses résultats.
- Preuve de concept (POC) utilisant le système de publication Quarto pour la génération de sites web bibliothèque numérique, permettant la navigation et la visualisation de données déposées sur l'entrepôt Nakala. Ce POC démontre la capacité de Quarto à traiter une grande diversité de contenus scientifiques, avec des exemples de visualisation d'images, de spatialisation, et de statistiques.
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