Ce projet utilise Snakemake et Singularity pour gérer des workflows bioinformatiques sur des clusters de calcul haute performance. Il permet l'analyse de données génomiques en utilisant des conteneurs pour assurer la reproductibilité et la portabilité des analyses.

SAMBA est un outil permettant l'échantillonnage de flux sur des réseaux métaboliques, la prédiction de biomarqueurs ou de profils métaboliques pour des conditions spécifiques et la représentation des résultats de manière visuelle. Il utilise un pipeline Snakemake pour gérer l'ensemble du workflow, allant d'un réseau métabolique et d'un ensemble de scénarios de réactions ou de gènes à perturber, jusqu'à un score de changement (z-score) pour chaque métabolite d'échange dans le réseau, pour chaque scénario de perturbation.