SAMBA
Notoriété 7 %
SAMBA est un outil permettant l'échantillonnage de flux sur des réseaux métaboliques, la prédiction de biomarqueurs ou de profils métaboliques pour des conditions spécifiques et la représentation des résultats de manière visuelle. Il utilise un pipeline Snakemake pour gérer l'ensemble du workflow, allant d'un réseau métabolique et d'un ensemble de scénarios de réactions ou de gènes à perturber, jusqu'à un score de changement (z-score) pour chaque métabolite d'échange dans le réseau, pour chaque scénario de perturbation.
Dépôt de code
Cas d'utilisation métiers
Organisation
- Centres de recherche régionaux de l'INRAE (organisation rattachée)
Description générée le mardi 19 mars 2024 à 08:55:05
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