RattleSNP est un projet dédié à l'analyse de données génomiques, proposant un workflow snakemake pour le mapping de données simples ou appariées. Il offre des fonctionnalités de visualisation de données biologiques grâce à matplotlib et tabulate, ainsi qu'une gestion optimisée des dépendances grâce à biopython, numpy et pandas.

Le projet biotools est un ensemble de scripts Perl dédiés à l'analyse et la gestion de données biologiques. Il permet d'automatiser des workflows de laboratoire et de faciliter le traitement de données de recherche en biologie.

Projet dédié à l'analyse et à la gestion de données biologiques, en particulier pour l'assemblage de génomes. Il utilise des données sources de l'ENA et fournit une annotation détaillée.

Le projet sra-tools est un ensemble d'outils en ligne de commande permettant l'analyse et le traitement de données de séquençage à haut débit. Il inclut le SRA Toolkit et le SDK de NCBI, et permet la gestion et la manipulation de données du SRA (Sequence Read Archive). Ce projet est utilisé dans la recherche en biologie des séquences.

Le plugin Google Gson pour Icy est une bibliothèque permettant la gestion et l'analyse d'images biologiques. Il offre des fonctionnalités de traitement et de visualisation d'images, ainsi que la gestion de données associées. Développé par des membres ou anciens membres de l'unité BioImage Analysis de l'Institut Pasteur, ce plugin est distribué sous licence GPL3.

Le projet Cluster est une plateforme dédiée à l'analyse de données biologiques. Il permet la gestion de workflows de recherche et l'automatisation de tâches de laboratoire, offrant ainsi une solution complète pour les chercheurs en biologie.

Le projet caspo-flux permet la gestion de workflows de simulations biologiques et l'intégration de données expérimentales, suivies d'une visualisation des résultats. Il offre une interface conviviale pour les utilisateurs, leur permettant de définir et exécuter des simulations, ainsi que d'analyser et de visualiser les résultats.

Frangipane est un projet dédié à l'analyse et la visualisation de données biologiques, offrant une gestion simplifiée des workflows de recherche. Il permet aux scientifiques d'accélérer et d'optimiser leurs processus de recherche en fournissant des fonctionnalités d'analyse avancées et de visualisation claire et interactive.

Thaliadb est une plateforme dédiée à la gestion, l'analyse et la visualisation de données de recherche en biologie, en particulier dans le domaine de la génomique. Elle offre des fonctionnalités avancées pour l'exploration et l'interprétation des données, ainsi que des outils de collaboration pour faciliter le travail en équipe.

Brace Root est un projet dédié à la contribution à la stabilité mécanique et à l'analyse de données biologiques. Il est disponible via Miniconda et offre des fonctionnalités telles que la gestion d'environnement virtuel, la construction et l'installation à partir de sources.