sra-tools

Le projet sra-tools est un ensemble d'outils en ligne de commande permettant l'analyse et le traitement de données de séquençage à haut débit. Il inclut le SRA Toolkit et le SDK de NCBI, et permet la gestion et la manipulation de données du SRA (Sequence Read Archive). Ce projet est utilisé dans la recherche en biologie des séquences.

Dépôt de code

https://forgemia.inra.fr/gafl/singularity/sra-tools (nouvelle fenêtre)

Cas d'utilisation métiers

Recherche en biologie des séquences : rechercher des initiatives proches
Analyse et traitement de données de séquençage à haut débit : rechercher des initiatives proches
Gestion et manipulation de données du SRA (Sequence Read Archive) : rechercher des initiatives proches

Organisation

Administration centrale
- Gouvernement (Premier ministre et ministères)
  - Ministère de l’Agriculture, de l'Agro-alimentaire et de la Souveraineté alimentaire
    - Établissements d'enseignement et de recherche - Ministère chargé de l’Agriculture, de l'Agro-alimentaire et de la Souveraineté alimentaire
      - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement - Paris
        Centres de recherche régionaux de l'INRAE (organisation rattachée)

Description générée le lundi 18 mars 2024 à 00:39:24

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