RattleSNP est un projet dédié à l'analyse de données génomiques, proposant un workflow snakemake pour le mapping de données simples ou appariées. Il offre des fonctionnalités de visualisation de données biologiques grâce à matplotlib et tabulate, ainsi qu'une gestion optimisée des dépendances grâce à biopython, numpy et pandas.

Ce projet fournit un algorithme pour le traitement et l'analyse de données de séquençage génomique, permettant la détection de variantes et l'alignement de séquences. Il offre une solution robuste et efficace pour la gestion de données de séquençage haut débit.

Le projet gattlab est une plateforme dédiée à l'analyse de données génomiques. Il permet la recherche de variations génétiques, le développement d'outils de bio-informatique et la gestion de workflows de génomique. Il offre des fonctionnalités avancées pour les chercheurs et professionnels du domaine de la génomique.

Mcgdb-seqdiag est un projet dédié à la gestion et l'analyse de données génomiques, offrant une visualisation de séquences de bases et facilitant la collaboration entre les utilisateurs. Il permet de gérer et d'analyser des données génomiques de manière efficace et intuitive.

Thaliadb est une plateforme dédiée à la gestion, l'analyse et la visualisation de données de recherche en biologie, en particulier dans le domaine de la génomique. Elle offre des fonctionnalités avancées pour l'exploration et l'interprétation des données, ainsi que des outils de collaboration pour faciliter le travail en équipe.

Meteor est un outil d'analyse de données génomiques permettant la gestion et l'analyse de données de séquençage. Il offre la possibilité de générer des rapports détaillés sur les résultats de séquençage.

Projet dédié à l'analyse et à la gestion de données biologiques, en particulier pour l'assemblage de génomes. Il utilise des données sources de l'ENA et fournit une annotation détaillée.

Le projet gandalf_snake est un outil d'analyse de données génomiques et transcriptomiques. Il permet de réaliser des opérations de variant calling et d'alignement de séquences RNA. Il est basé sur le framework Snakemake et utilise des environnements Conda pour la gestion des dépendances.

MarDB est un projet dédié à la gestion et l'analyse de données génomiques marines. Il permet le téléchargement, la compression et l'organisation de fichiers de séquences, ainsi que la sanitation des noms de génomes pour éviter les conflits avec d'autres formats de fichiers.

BiSePSGUI est une application de bureau permettant d'analyser des données de séquençage de bisulfite entier de génome. Il s'agit d'une application Mongodb/express/React/Nodejs bundlée avec webpack et empaquetée dans une application de bureau à l'aide d'Electron. Il exécute un pipeline snakemake localement ou sur des machines distantes via des informations d'identification ssh. Il dépend de git et de Conda pour la gestion des workflows et des dépendances. Il prend en charge l'exécution sur des clusters SLURM.