BiSePSGUI
Notoriété 10 %
BiSePSGUI est une application de bureau permettant d'analyser des données de séquençage de bisulfite entier de génome. Il s'agit d'une application Mongodb/express/React/Nodejs bundlée avec webpack et empaquetée dans une application de bureau à l'aide d'Electron. Il exécute un pipeline snakemake localement ou sur des machines distantes via des informations d'identification ssh. Il dépend de git et de Conda pour la gestion des workflows et des dépendances. Il prend en charge l'exécution sur des clusters SLURM.
Dépôt de code
Cas d'utilisation métiers
- Gestion des dépendances et des configurations avec Conda et git : rechercher des initiatives proches
- Analyse de données de séquençage de bisulfite entier de génome : rechercher des initiatives proches
- Exécution de workflows sur des clusters SLURM : rechercher des initiatives proches
- Configuration et exécution de pipelines de traitement de données : rechercher des initiatives proches
Cas d'utilisation fonctionnels
Organisation
- Centres de recherche régionaux de l'INRAE (organisation rattachée)
Outils utilisés
- Git : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi
- Webpack : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi
- MongoDB : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi
- Electron : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi
- React : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi
Description générée le mardi 19 mars 2024 à 19:47:51
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