BLAST+ est un nouvel ensemble d'outils BLAST qui utilise le kit NCBI C++. Il permet l'analyse de séquences biologiques, la recherche de similarités entre séquences et l'identification de gènes et de protéines.

Ce projet est un pipeline Nextflow permettant d'identifier les gènes orthologues entre plusieurs génomes et de détecter les blocs de synténie à l'aide des outils OrthoFinder et MCScanX. Il prend en entrée des fichiers FASTA et GFF3 ou des protéines et GFF3, et produit des résultats détaillés sur l'organisation génomique comparée.

Ce projet vise à analyser et annoter le génome de la souche de levure Zygosaccharomyces bailii CLIB 213, en identifiant les gènes codant des protéines et des pseudogènes, ainsi que les ARN de transfert et de ribosomes.

Ce programme permet de trouver les peptides uniques à une espèce, un genre ou une famille, ou de combiner des peptides uniques pour identifier une protéine, à partir d'une liste de peptides.