MetaQTL est un outil dédié à l'analyse et à la visualisation de données génétiques, notamment pour l'identification et la cartographie de loci de caractères quantitatifs (QTL). Il permet aux chercheurs en génétique et en biologie végétale ou animale de modéliser, comparer et visualiser des données issues de différentes cartes génétiques afin d'identifier des régions génomiques associées à des traits d'intérêt.

Meta-analyse de données multi-omiques pour explorer l'évolution du génome de la pomme après un doublement du génome complet. Les workflows d'analyse comprennent l'identification de blocs synténiques, l'analyse de la fractionation des gènes, l'analyse des loci de caractères quantitatifs, l'estimation des modèles d'évolution à l'aide de Ka/Ks, l'analyse de l'expression (RNA-seq), l'analyse des éléments transposables, l'analyse du méthylome (BS-DNAseq) et une analyse intégrative.

Biomercator est un outil dédié à l'analyse et à la visualisation de données génétiques végétales. Il permet aux chercheurs et sélectionneurs de cartographier les marqueurs génétiques, d'identifier les loci de caractères quantitatifs (QTL) et de réaliser des méta-analyses pour comparer des cartes génétiques issues de différentes études. L'application facilite l'interprétation des résultats et la prise de décision en amélioration génétique.