sub-chromomal-dominance-purged
Meta-analyse de données multi-omiques pour explorer l'évolution du génome de la pomme après un doublement du génome complet. Les workflows d'analyse comprennent l'identification de blocs synténiques, l'analyse de la fractionation des gènes, l'analyse des loci de caractères quantitatifs, l'estimation des modèles d'évolution à l'aide de Ka/Ks, l'analyse de l'expression (RNA-seq), l'analyse des éléments transposables, l'analyse du méthylome (BS-DNAseq) et une analyse intégrative.
Dépôt de code
Cas d'utilisation métiers
- Identification de blocs synténiques entre génomes : rechercher des initiatives proches
- Estimation des modèles d'évolution à l'aide de Ka/Ks : rechercher des initiatives proches
- Analyse de données multi-omiques pour étudier l'évolution du génome d'une plante après un doublement du génome complet : rechercher des initiatives proches
- Analyse des loci de caractères quantitatifs : rechercher des initiatives proches
- Analyse de la fractionation des gènes : rechercher des initiatives proches
Cas d'utilisation fonctionnel
Organisation
- Centres de recherche régionaux de l'INRAE (organisation rattachée)
Outils utilisés
- Selenium : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi
- NumPy : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi
- IPython : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi
- Tornado : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi
- Matplotlib : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi
- Pandas : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi
- SciPy : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi
- Jupyter : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi
Description générée le dimanche 17 mars 2024 à 23:47:19
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