Decomics est une application interactive dédiée à l'analyse et à la déconvolution de données omics (transcriptomique, métabolomique, etc.). Elle permet aux chercheurs et biologistes de décomposer des échantillons complexes en sous-populations cellulaires ou moléculaires, facilitant ainsi l'interprétation des résultats expérimentaux. L'outil propose des méthodes non supervisées et des visualisations dynamiques pour explorer les données biologiques.

Le Bioimaging Desktop est une plateforme dédiée à l'analyse et à la visualisation d'images biologiques et microscopiques. Elle fournit aux chercheurs et scientifiques des outils spécialisés pour manipuler, analyser et interpréter des données d'imagerie issues de divers domaines comme la biologie cellulaire, la pathologie numérique ou la bioinformatique. Intégrée à l'écosystème Biosphère, elle facilite la gestion et le partage de données d'imagerie complexes.

Outil dédié à l'analyse de données de séquençage ARN à haut débit (RNA-seq) pour identifier les gènes dont l'expression est modifiée entre différentes conditions biologiques. Permet aux chercheurs en biologie computationnelle et en génomique de traiter des tableaux d'expression génique, de générer des visualisations statistiques et de produire des rapports automatisés pour faciliter l'interprétation des résultats expérimentaux.

Bioviz-js est une bibliothèque JavaScript dédiée à la visualisation de données biologiques complexes. Elle permet aux chercheurs et biologistes de représenter des génomes, des cladogrammes, des QTL et d'autres données génétiques sous forme de graphiques interactifs. L'outil facilite l'analyse et l'interprétation des données pour des applications en génomique, phylogénie et biologie moléculaire.

Outil dédié à l'analyse et au traitement de données biologiques et génomiques. Permet aux chercheurs et biologistes de manipuler des fichiers de séquençage, automatiser des pipelines bioinformatiques et générer des rapports détaillés. Facilite l'interprétation des données génomiques pour des applications en recherche médicale ou agronomique.

Application dédiée à la visualisation et à l'analyse de cartes de densité électronique issues de fichiers PDB et MTZ. Elle permet aux chercheurs et scientifiques d'explorer des données structurales biologiques, notamment dans le cadre de la recherche en biologie moléculaire et en cristallographie. Intégrée au Data Portal, elle facilite l'interprétation des structures moléculaires pour des études avancées.

Projet dédié à l'analyse et à la visualisation de données de cellules uniques, principalement utilisé en biologie cellulaire et génomique. Il permet aux chercheurs de traiter, interpréter et partager des données complexes issues de séquençage à haut débit. L'outil facilite la compréhension des mécanismes cellulaires et contribue à des avancées scientifiques dans le domaine de la biologie.

Stoic est une méthode d'analyse bioinformatique conçue pour identifier des associations significatives entre deux types de données biologiques distinctes. Elle permet de regrouper des observations dans un espace de données principal en utilisant des informations complémentaires issues d'un second jeu de données. Cette approche améliore les méthodes traditionnelles en évitant les biais liés à un clustering non guidé et en fournissant des interprétations biologiques claires des clusters obtenus.

Outil dédié à l'analyse approfondie de données issues du séquençage RNA (RnaSeq). Il permet aux chercheurs et biologistes d'interpréter les résultats de séquençage en générant des rapports détaillés sur l'expression des gènes. Le script facilite la comparaison entre différents échantillons et génotypes, aidant ainsi à identifier des variations biologiques ou des réponses à des traitements.

Java3D for Icy est un plugin dédié à l'analyse d'images biologiques, développé pour le logiciel Icy. Il permet d'ajouter des fonctionnalités de visualisation 3D avancées aux images issues de la microscopie ou d'autres techniques d'imagerie biomédicale. Ce plugin facilite l'exploration et l'interprétation des données complexes en offrant des outils adaptés aux besoins des chercheurs en biologie et en imagerie médicale.