Le projet rnaseq est un workflow optimisé pour l'analyse de données RNA-seq, utilisant des conteneurs Singularity pour les logiciels et le langage de description de workflow Nexflow. Il permet l'alignement de génomes et la quantification de transcrits, avec une optimisation des ressources informatiques et une utilisation sur une ferme informatique avec un scheduler Slurm.

Genome_aln est un workflow écrit en Nexflow dsl2, optimisé pour les ressources informatiques et destiné à être utilisé sur une ferme informatique avec un scheduler Slurm. Il permet le prétraitement de données de séquençage d'ADN, y compris le contrôle de la qualité et le retranchement des adaptateurs, l'alignement des lectures sur un génome de référence, le filtrage des lectures et la normalisation des fichiers bigWig.

Ce projet fournit une image conteneurisée pour faciliter le déploiement et la gestion de services informatiques au sein d'un environnement EOLE. Il permet une intégration fluide avec des outils DevOps pour automatiser les processus de déploiement, de test et de maintenance, tout en assurant une sécurité renforcée et une optimisation des ressources. Destiné aux administrateurs système et aux développeurs, il simplifie la gestion des services en conteneurs.

Bibliothèque Rust pour les planificateurs Batsim, permettant l'optimisation de l'utilisation des ressources informatiques et la simulation de charges de travail informatiques. Créez des planificateurs personnalisés pour les systèmes informatiques grâce à cette API Rust.

Datsched est un programme permettant de gérer l'ordonnancement de tâches informatiques sur des ressources. Il utilise une file d'attente pour organiser les tâches selon un algorithme défini et optimise l'utilisation des ressources informatiques.

Pybatsim est une API Python permettant de simuler des centres de données et de gérer des tâches informatiques distribuées. Il vise à optimiser l'utilisation des ressources informatiques en fournissant des algorithmes d'ordonnancement avancés.

Le projet cgi est une workflow d'analyse de séquences d'ADN, optimisée en termes de ressources informatiques, qui permet de définir des îlots CpG à l'aide des outils EMBOSS newcpgreport et UCSC cpg_lh, de calculer les comptages de C, G et CpG, ainsi que les rapports d'observation/attente de CpG sur des fenêtres glissantes.

Service dédié à la collecte de données sur la consommation d'énergie des équipements informatiques, permettant de générer des rapports sur l'utilisation des ressources et d'optimiser la gestion de parc informatique.

Batsim est un simulateur de centres de calcul permettant d'optimiser l'allocation des ressources informatiques et de prédire les performances de systèmes informatiques. Il offre une API flexible pour intégrer différents types de politiques d'ordonnancement et de modèles de consommation d'énergie.

Batsim est un simulateur de tâches et de ressources pour les environnements de calcul haute performance. Il permet de modéliser et d'analyser le comportement des machines, des tâches et des workflows dans des clusters informatiques. L'outil est utilisé pour évaluer des politiques d'ordonnancement, optimiser l'utilisation des ressources et réduire la consommation énergétique des infrastructures.