genome_aln
Genome_aln est un workflow écrit en Nexflow dsl2, optimisé pour les ressources informatiques et destiné à être utilisé sur une ferme informatique avec un scheduler Slurm. Il permet le prétraitement de données de séquençage d'ADN, y compris le contrôle de la qualité et le retranchement des adaptateurs, l'alignement des lectures sur un génome de référence, le filtrage des lectures et la normalisation des fichiers bigWig.
Cas d'utilisation métiers
- Prétraitement de données de séquençage d'ADN : rechercher des initiatives proches
- Normalisation de fichiers bigWig : rechercher des initiatives proches
- Filtrage de lectures de séquençage : rechercher des initiatives proches
- Alignement de séquences sur un génome de référence : rechercher des initiatives proches
Organisation
- Centres de recherche régionaux de l'INRAE (organisation rattachée)
Description générée le lundi 18 mars 2024 à 09:58:18
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