Annuaire des initiatives
Pertinence
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- Ce projet vise à publier les résultats d'une enquête inter-DREAL sur la définition d'un produit à élaborer dans le cadre d'un deuxième projet de publication statistique coordonnée des DREAL. Il utilise la méthode ProPRe (Processus de publication reproductible) pour analyser et visualiser les données énergétiques et environnementales.
- SAMBA est un workflow FAIR et évolutif qui intègre des méthodes bioinformatiques et statistiques de pointe pour la réalisation d'analyses reproductibles d'eDNA à l'aide de Nextflow. Le workflow vérifie l'intégrité des lectures brutes et des métadonnées, effectue toutes les étapes de bioinformatique à l'aide de procédures couramment utilisées (QIIME 2 et DADA2) et ajoute de nouvelles étapes utilisant dbOTU3 et microDecon pour créer des tableaux de compte ASV de haute qualité. Des analyses statistiques étendues sont également effectuées. Enfin, SAMBA produit un rapport HTML complet et dynamique incluant les ressources utilisées, les commandes exécutées, les résultats intermédiaires, les analyses statistiques et les figures.
- Notoriété 7 %Ce projet vise à rassembler des tentatives de reproduction de l'étude Challenger, qui analyse les facteurs de risque dans le programme de la navette spatiale. Il compare les résultats obtenus en utilisant différents langages de programmation et outils, et met l'accent sur la reproductibilité des analyses statistiques.
- Ce projet académique, développé dans le cadre de la licence MIAGE 3, vise à enseigner les modèles statistiques et la programmation lettrée. Il propose des ressources pédagogiques, des travaux dirigés et un mini-projet à réaliser en binôme. Les étudiants apprennent à manipuler des données, générer des rapports automatisés et présenter leurs résultats de manière reproductible.
- Ce projet vise à éliminer les résultats de neuroimagerie non reproductibles, surnommés 'zombies', en promouvant l'utilisation de données ouvertes et de méthodes standardisées. Il propose des pipelines de pré-traitement, de contrôle qualité et d'analyse statistique accessibles à tous, afin de garantir la fiabilité et la réplicabilité des résultats scientifiques. L'objectif est de transformer les données brutes en ressources vivantes, vérifiables et partagées par la communauté.
- Projet open source visant à reproduire et automatiser les tutoriels du logiciel SPM (Statistical Parametric Mapping) pour l'analyse de données d'imagerie par résonance magnétique fonctionnelle (IRMf). Il permet de traiter des données brutes, effectuer des prétraitements (alignement, segmentation, normalisation), modéliser des réponses cérébrales et générer des résultats reproductibles pour des études en neurosciences.
- Outil open source conçu pour automatiser et orchestrer des workflows d'analyse d'imagerie cérébrale fonctionnelle (IRMf). Il permet de construire des chaînes de traitement à partir de descriptions de configurations, d'exécuter ces workflows en parallèle sur des clusters de calcul, puis de post-traiter les résultats pour en extraire des statistiques et des corrélations. Destiné aux chercheurs et cliniciens en neurosciences, il facilite la reproductibilité et l'analyse comparative des données.
- Ce projet revisite une étude scientifique analysant comment les choix analytiques influencent les résultats. Il propose une réplication des analyses originales avec des données mises à jour et une documentation détaillée des écarts méthodologiques. L'objectif est de rendre transparentes les variations dans les approches statistiques et de faciliter la reproductibilité des recherches.
- Ce projet permet de reproduire la méthodologie et les figures de l'étude « 100% santé » de la DREES. Il s'appuie sur les données du Baromètre d'opinion de la DREES pour analyser la perception des Français concernant la réforme « 100% santé ». Les résultats sont exportés sous forme de figures et de rapports, contribuant à la transparence et à la reproductibilité des analyses statistiques officielles.
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