SAMBA est un workflow FAIR et évolutif qui intègre des méthodes bioinformatiques et statistiques de pointe pour la réalisation d'analyses reproductibles d'eDNA à l'aide de Nextflow. Le workflow vérifie l'intégrité des lectures brutes et des métadonnées, effectue toutes les étapes de bioinformatique à l'aide de procédures couramment utilisées (QIIME 2 et DADA2) et ajoute de nouvelles étapes utilisant dbOTU3 et microDecon pour créer des tableaux de compte ASV de haute qualité. Des analyses statistiques étendues sont également effectuées. Enfin, SAMBA produit un rapport HTML complet et dynamique incluant les ressources utilisées, les commandes exécutées, les résultats intermédiaires, les analyses statistiques et les figures.