omics-catalog
Notoriété 15 %
OMICS-CATALOG est un outil basé sur un pipeline Nextflow qui implémente une session de navigateur de génomes pour visualiser les données omiques et met en place un catalogue interactif de génomes basé sur l'outil de visualisation de données Keshif. Le catalogue fournit la liste des organismes modèles disponibles, ainsi que les métadonnées telles que la lignée, la version du génome, le soumetteur, etc. Pour visualiser les données omiques des organismes modèles, le catalogue donne accès à la session du navigateur de génomes, qui est implémentée en utilisant le visualiseur JBrowse2.
Dépôt de code
Cas d'utilisation métiers
- Visualisation de données omiques
- Création d'un catalogue interactif de génomes
- Accès à un navigateur de génomes pour visualiser les données omiques
Cas d'utilisation fonctionnels
- Possède un système de recherche
- Possède un système d'authentification
Organisation
- Institut français de recherche pour l'exploitation de la mer (organisation rattachée)
Description générée le lundi 18 mars 2024 à 11:25:00
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