CNW-Grass est un modèle fonctionnel de structure végétale (FSPM) dédié à l'étude des graminées. Il simule la croissance des plantes en intégrant la morphogenèse, le métabolisme du carbone et de l'azote, ainsi que les flux d'eau. Le modèle prend en compte des paramètres pédoclimatiques (température, lumière, humidité, CO2, etc.) pour prédire le développement des organes végétaux, la photosynthèse, la transpiration et la sénescence. Il est utilisé en recherche agronomique pour optimiser les pratiques culturales et comprendre les interactions entre croissance végétale et environnement.

MOSICAS est un modèle de croissance végétale dédié aux cultures géantes de type C4, comme la canne à sucre. Il simule l'évolution de la biomasse en fonction des conditions climatiques (température, précipitations, rayonnement) et des propriétés du sol. L'outil permet d'évaluer l'impact des stress hydriques et thermiques sur le développement des plantes, facilitant ainsi l'optimisation des pratiques agricoles et l'adaptation aux changements climatiques.

OpenAlea.Adel est un outil de modélisation et de simulation dédié à l'étude du développement architectural des plantes graminées. Il permet de reproduire en 3D la croissance et la morphologie des plantes, facilitant ainsi la recherche agronomique et l'analyse des interactions entre génétique et environnement. Les modèles intégrés, comme Adel-Maize et Adel-Wheat, aident à comprendre les mécanismes de développement végétal et à optimiser les pratiques culturales.

ArchiCrop est un modèle paramétrique 3D+t pour les plantes céréalières qui permet de générer des architectures végétales à partir de données agronomiques 1D+t. Il utilise des lois allométriques pour définir une plante potentielle avec peu de paramètres, tout en respectant des contraintes de croissance globales issues de modèles culturaux. L'approche repose sur le concept d'équifinalité, permettant de simuler des plantes équivalentes malgré des conditions initiales différentes.

Vitis est un outil de modélisation et de simulation dédié à l'étude de la croissance des plantes et de leur architecture. Il permet d'analyser des processus physiologiques comme l'interception de la lumière, la gestion de l'eau ou la répartition des biomasses. Utilisé en recherche agronomique et forestière, il aide à comprendre les mécanismes de développement végétal et à évaluer l'impact des conditions environnementales sur les plantes.

MetaFSPM est un cadre logiciel open source conçu pour faciliter la modélisation fonctionnelle et structurelle des plantes (FSPM). Il permet aux chercheurs et modélisateurs de créer, coupler et exécuter des modèles de croissance végétale de manière générique et modulaire. Le projet vise à standardiser les échanges entre différents modèles botaniques tout en restant flexible pour s'adapter à divers types de plantes et d'environnements. Il intègre des outils pour la visualisation 3D et l'analyse des données simulées.

Openalea components est un projet dédié à la simulation de croissance de plantes et à la modélisation 3D de scènes végétales. Il permet également l'analyse de données botaniques grâce à des outils spécifiques.

Root-CyNAPS est un modèle 3D de simulation fonctionnelle et structurelle des racines végétales. Il permet d'étudier les processus liés au transport et au métabolisme de l'azote, ainsi que le transport de l'eau dans les racines. Le logiciel prend en compte des paramètres comme la température du sol, les surfaces d'échange et la masse structurale des segments racinaires. Il simule les flux hétérogènes à l'échelle du système racinaire en intégrant des données d'architecture racinaire, de coûts de croissance et de concentrations en hexoses labiles.

Package Python dédié à la simulation de la croissance, de la division et de la rigidification des tissus végétaux sur une structure 2D. Il s'appuie sur des librairies telles que numpy, scipy, imageio et matplotlib.