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Pertinence
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- Ce projet permet d'analyser la concentration de drogues dans des bactéries à partir d'images obtenues par microscopie à fluorescence. Il suit la méthode décrite par Julia et al. dans l'article « Spectrofluorimetric quantification of antibiotic drug concentration in bacterial cells for the characterization of translocation across bacterial membranes » publié dans Nature Methods en 2018. Le projet permet de traiter les images (enregistrement et segmentation des bactéries) et de stocker les données dans un fichier HDF. Un visualiseur utilisant des widgets Jupyter est ensuite utilisé pour analyser les données.
- Le projet docker-registry permet de déployer un registre privé de conteneurs Docker, géré de manière infrastructure as code grâce à Terraform. Ce registre permet aux développeurs de stocker, partager et déployer des images Docker en toute sécurité, en bénéficiant d'une gestion fine des accès et des autorisations.
- Le projet Deploiement permet de construire une image Docker unique pour le frontend et le backend de l'application UTChange, en utilisant deux volumes pour stocker les photos des articles et la base de données. Il permet également de gérer les secrets et d'ajuster le nom de domaine en fonction de l'environnement.
- Google FlatBuffers est une bibliothèque de sérialisation de données binaires compactes et efficace, conçue pour permettre un accès rapide aux données sans décompression ou parsing préalable. Elle est utilisée dans le plugin Google FlatBuffers pour Icy, un logiciel d'analyse d'images biologiques, pour stocker et échanger des données de manière efficace.
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