Treat2p est un package développé pour étendre les fonctionnalités de suite2p, un outil d'extraction de données de neuroimagerie. Il permet d'ajouter des traitements supplémentaires aux données extraites par suite2p, en utilisant numpy pour les opérations mathématiques et de traitement de données.

Outil dédié à la modélisation et à l'analyse de pipelines d'imagerie par résonance magnétique fonctionnelle (fMRI). Il permet de générer et d'évaluer des configurations de traitement de données cérébrales, facilitant ainsi la recherche en neurosciences. Le projet aide les chercheurs à optimiser leurs protocoles d'acquisition et d'analyse pour des études en neuroimagerie.

Ce projet vise à éliminer les résultats de neuroimagerie non reproductibles, surnommés 'zombies', en promouvant l'utilisation de données ouvertes et de méthodes standardisées. Il propose des pipelines de pré-traitement, de contrôle qualité et d'analyse statistique accessibles à tous, afin de garantir la fiabilité et la réplicabilité des résultats scientifiques. L'objectif est de transformer les données brutes en ressources vivantes, vérifiables et partagées par la communauté.

Ce projet vise à évaluer la variabilité analytique dans les analyses de neuroimagerie fonctionnelle (fMRI) à grande échelle. Il explore différentes configurations de pipelines de traitement d'images cérébrales pour identifier les sources de variabilité dans les résultats. Les données proviennent de sujets de l'Human Connectome Project et sont analysées via des notebooks Jupyter. Les résultats sont présentés sous forme de graphiques et de figures pour une publication scientifique lors du congrès OHBM 2026.

Ce projet vise à affiner et explorer la variabilité dans les pipelines d'imagerie cérébrale fonctionnelle (fMRI). Il permet de modéliser, exécuter et analyser différentes configurations de traitement des données neuroimagers pour évaluer leur impact sur les résultats. Les outils développés facilitent la comparaison de méthodes, l'identification des configurations optimales et la génération de rapports analytiques pour la recherche en neurosciences.