Le plugin Ruler Helper est un outil développé pour le logiciel de bioimage analysis Icy, qui permet de mesurer des distances sur des images en tenant compte de l'échelle de l'image. Il est utilisé par les membres ou anciens membres de l'unité BioImage Analysis de l'Institut Pasteur.

WaterShed 3D est un plugin pour le logiciel d'analyse d'images Icy, développé par des membres ou anciens membres de l'unité BioImage Analysis de l'Institut Pasteur. Ce plugin met en œuvre l'algorithme du watershed seeded et peut être utilisé pour la segmentation de taches sur des images 3D où les centres des taches sont très lumineux, ou en combinaison avec une carte de distance pour séparer les objets qui se touchent.

Bibliothèque JFree Common pour Icy, un logiciel d'analyse d'images biologiques développé par l'unité BioImage Analysis de l'Institut Pasteur. Cette bibliothèque est utilisée pour fournir des fonctionnalités de traitement et de visualisation d'images avancées.

Le plugin JOCL est un outil développé pour le logiciel de bioimage analysis Icy, qui permet l'analyse et le traitement d'images biologiques en temps réel en utilisant la bibliothèque JOCL de JogAmp.

Le plugin Stereo VTK Canvas est une extension pour le logiciel bioimage Icy, qui permet l'affichage stéréoscopique des données 3D utilisant la bibliothèque VTK. Il a été développé par des membres ou anciens membres de l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur.

Le plugin MsgPack Core est une bibliothèque pour le logiciel Icy, dédié à l'analyse d'images biologiques. Il permet le traitement et l'échange de données bioimage en utilisant le format de sérialisation efficace MsgPack, offrant ainsi une compression et un transfert de données performants.