PAPPSOms++ est une bibliothèque C++ complète comprenant des fonctions utiles pour gérer les données de spectrométrie de masse, que ce soit dans un contexte protéomique ou pour la visualisation de données. Les abstractions incluent les peptides, les protéines, les clusters isotopiques, les spectres de masse...

Ensemble d'outils pour l'analyse des données métaprotéomiques générées par des instruments de spectrométrie de masse de haute throughput. Ces outils permettent de regrouper les abondances de peptides et protéines, exprimées en comptages spectraux, et de les manipuler en groupes de métaprotéines. Les informations obtenues peuvent être représentées à l'aide de fonctions de visualisation multiples pour afficher le paysage métaprotéomique global et différencier les échantillons ou conditions en termes d'abondance de métaprotéines, de niveaux taxonomiques et/ou d'annotation fonctionnelle.