LemonLDAP::NG est une solution Web-SSO modulaire basée sur les modules Apache::Session. Il offre une authentification unique pour plusieurs applications, une gestion des droits d'accès et une personnalisation de l'expérience utilisateur.

Le projet CLIP OS est un système d'exploitation basé sur Linux, conçu pour offrir une sécurité renforcée et une gestion simplifiée des profils utilisateur. Il permet une configuration réseau avancée, une gestion des paquets logiciels facilitée et une sécurisation des données optimale.

Le plugin Roundcube-Plugin-Roundrive permet de connecter un serveur WebDAV (tel que ownCloud) à Roundcube, offrant ainsi la possibilité d'ajouter des fichiers à des mails ou d'enregistrer des mails sous forme de fichiers dans le stockage WebDAV.

Le projet mel-suggestion est un outil de boîte à idées permettant aux utilisateurs de soumettre des suggestions et aux modérateurs de les gérer et de les modérer. Il offre également la possibilité de suivre l'état des suggestions.

This project is a repository that compares long-reads metagenomic assemblers and analyzes metagenomic data. It includes scripts to check the quality of the reads, fetch the sequencer used, assemble metagenomes using different tools, polish the assemblies, calculate the coverage, and check the quality of the assemblies. The pipeline is defined using Snakemake and can be run on a cluster with slurm and conda support.

DeCovA est un outil en ligne de commande écrit en Perl qui permet d'analyser la couverture de séquençage d'ADN et de détecter des variations du nombre de copies (CNV). Il prend en entrée des fichiers BAM et une annotation génomique et produit des graphiques et des fichiers de sortie contenant des informations sur la profondeur de couverture et les CNV.

Outil d’extraction de corpus ISTEX permettant de décharger un corpus de fichiers textes, de fichiers de métadonnées ou de fichiers d’enrichissement depuis la base ISTEX à partir d’une requête ou d’un fichier .corpus. Il est possible d’avoir ce programme sous forme d’une image Docker.

Le projet UTOPIA vise à construire une base de données de séquences d'ADN fongiques et à fournir des outils pour l'analyse et l'identification des espèces fongiques. Il permet de télécharger des données à partir de sources publiques, de formater et de nettoyer ces données, de les comparer à la base de données taxonomique de NCBI et de produire des fichiers de sortie normalisés.

Alpi est un script Perl qui aide les utilisateurs à installer localement le logiciel ALPAGE. Il peut également être utilisé pour installer une chaîne de traitement de langage naturel complète pour le français, y compris DyALog, FRMG, lefff, lefff-frmg et sxpipe. Un serveur de parseur est également installé.

Le projet biotools est un ensemble de scripts Perl dédiés à l'analyse et la gestion de données biologiques. Il permet d'automatiser des workflows de laboratoire et de faciliter le traitement de données de recherche en biologie.