InGenAnnot
Notoriété 10 %
InGenAnnot est un ensemble d'utilitaires permettant d'inspecter et de générer des statistiques pour un ou plusieurs jeux d'annotations géniques. Il permet la comparaison de structures et peut aider à prioriser les efforts de curation manuelle. InGenAnnot utilise parmi d'autres choses, la classification SO des gènes-spliceage [SO [1]] qui vise à classer les alternates transcrits en sept catégories ou l'Annotation Edit Distance [AED [2]] proposé comme métrique pour le soutien des preuves.
Dépôt de code
Cas d'utilisation métiers
- Comparaison de structures d'annotations géniques : rechercher des initiatives proches
- Analyse de jeux de données d'annotations géniques : rechercher des initiatives proches
- Sélection de modèles d'annotation génique optimaux : rechercher des initiatives proches
- Réannotation des UTRs : rechercher des initiatives proches
Organisation
- Centres de recherche régionaux de l'INRAE (organisation rattachée)
Description générée le mercredi 20 mars 2024 à 08:04:20
D'autres initiatives de la même organisation
- osrmgithub.com/riatelab/osrm
- support-de-formationforgemia.inra.fr/git-gitlab-paca/support-de-formation
- gustavegithub.com/InseeFr/gustave
- metagWGSforgemia.inra.fr/genotoul-bioinfo/metagwgs