cut_scaffolds_to_contigs_by_n

Ce script utilise seqkit et sed pour rechercher des séquences N dans un génome et les découper en nouvelles séquences. Le résultat est au format fasta.

Dépôt de code

https://forgemia.inra.fr/gafl/scripts/cut_scaffolds_to_contigs_by_n (nouvelle fenêtre)

Cas d'utilisation métiers

Organisation

Administration centrale
- Gouvernement (Premier ministre et ministères)
  - Ministère de l’Agriculture, de l'Agro-alimentaire et de la Souveraineté alimentaire
    - Établissements d'enseignement et de recherche - Ministère chargé de l’Agriculture, de l'Agro-alimentaire et de la Souveraineté alimentaire
      - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement - Paris
        Centres de recherche régionaux de l'INRAE (organisation rattachée)

Description générée le dimanche 17 mars 2024 à 23:20:30

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